Die Pfarrei St. Stefanus umfasst Ober- und Nieder-Wöllstadt, wobei St. Paulus Nieder-Wöllstadt als Filialgemeinde schon seit Jahrzenten über einen eigenen Pfarrgemeinde- und Verwaltungsrat verfügt. Da im traditionell sehr katholischen Ober-Wöllstadt die katholische Pfarrei schon immer eine sehr das örtliche Leben tragende und prägende Funktion hatte, unterscheiden sich Situation, Kultur und Themen von St. Stefanus deutlich von St. Paulus im traditionell evangelischen Nieder-Wöllstadt.
Beide Kirchengemeinden gehören zu einer Pfarrei und diese heißt St. Stefanus Ober-Wöllstadt.
Zwischen beiden Gemeinden besteht eine rege Kooperation. Beide PGR tagen regelmäßig zusammen, wenn auch nicht immer.