Ein Kennzeichen des TPI ist auch seine hervorragende ökumenische Zusammenarbeit. Seit 2010 führen das TPI und das Institut für Personalberatung, Organisationsentwicklung und Supervision (IPOS) der EKHN in gemeinsamer Trägerschaft unter dem Titel "Wer sich beraten lässt, ist klug" einen Qualifizierungskurs zur Kirchlichen Organisationsberatung für Menschen mit bereits vorliegenden beraterischen Ausbildungen durch. Bereits zweimal wurde das Angebot der "Systemischen Strategieentwicklung" für Gemeindeberater•innen in dieser Kooperation aufgelegt. Das TPI ist somit zu einem Anbieter von Aus- und Fortbildungskursen in diesem Feld geworden und wird im gesamten deutschsprachigen Raum bei kirchlichen Organisationsberater•innen wahrgenommen.
