Seit 28. August 2017 ist Prof. Dr. Peter Kohlgraf Bischof von Mainz.
Er hat am 9. Dezember 2023 Dr. Sebastian Lang zum Generalvikar ernannt. Als Bevollmächtigte des Generalvikars vervollständigt Stephanie Rieth seit 12. April 2022 das Dreierteam der Bistumsleitung.
Das Amt des Domdekans hat Henning Priesel inne. Verwaltet wird das Bistum Mainz durch das Bischöfliche Ordinariat in Mainz. Die einzelnen Arbeitsbereiche des Ordinariats unterteilen sich in Dezernate sowie das kirchliche Gericht, das Offizialat.
Die Leiterinnen und Leiter der Dezernate kommen jede Woche in der Leitungskonferenz zusammen. Sie beraten und entscheiden dabei über die wichtigeren Angelegenheiten des Bistums.
Ein wichtiger Teil der Leitungsarbeit liegt bei den Räten und Gremien auf unterschiedlichen Ebenen des Bistums. Dazu gehören die Konferenz der Leiter der Pastoralräume und Pfarreien, der Diözesanpastoralrat, die Diözesanversammlung, der Katholikenrat und der Priesterrat.
Auf lokaler Ebene werden Pfarrgemeinde- und Verwaltungsräte tätig und auf regionaler Ebene Seelsorgeräte, Dekanatsräte und Dekanatsversammlungen.